煤礦企業(yè)安全生產(chǎn)許可證頒發(fā)管理機關(guān)也很特殊，它不是省級人民政府的煤炭管理部門(mén)，而是國家垂直管理的省級煤礦安全監察機構?！栋踩a(chǎn)許可證條例》第三條規定，國家煤礦安全監察機構負責中央管理的煤礦企業(yè)安全生產(chǎn)許可證的頒發(fā)和管理。在省、自治區、直轄市設立的煤礦安全監察機構負責前款規定以外的其他煤礦企業(yè)安全生產(chǎn)許可證的頒發(fā)和管理，并接受?chē)颐旱V安全監察機構的指導和監督。

　　國家未設直屬煤礦安全監察機構的其他省、自治區、直轄市的煤礦企業(yè)安全生產(chǎn)許可證頒發(fā)管理機關(guān)，應當是《煤礦安全監察條例》授權的省、自治區、直轄市人民政府指定的部門(mén)，多數為省級安全生產(chǎn)監督管理局。在這些地方，省級安全生產(chǎn)監督管理局依法履行煤礦企業(yè)安全生產(chǎn)許可證頒發(fā)管理機關(guān)的全部職責。